感染性疾病的诊疗关键是早期、快速、准确发现病原微生物。靶向二代测序（tNGS）由于其技术优势和高检测性能，而越发受到临床的广泛关注和应用。然而，tNGS的临床规范化应用还尚未统一，导致应用场景、样本采集、实验室检测、临床解读、质量控制等方面参差不齐，限制了tNGS的合理应用。因此，中国医学装备协会检验医学分会组织专家制定该共识，以规范tNGS临床应用，发挥tNGS技术优势，为感染性疾病诊疗提供保障。