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孙铮+航空总医院
作者: 孙铮
单位: 航空总医院

摘要

检测原理

 核型:细胞培养→染色显带→显微镜人工核型判读

 FISH:荧光探针与样本DNA原位结合,荧光信号判读

CMA:基因芯片杂交,比对信号强弱判断拷贝数增减

WES:捕获全部外显子,高通量测序比对基因序列

 检测分辨率(精度,由低→高)

 核型:5~10Mb,仅看超大片段异常 FISH:几十Kb~Mb级,靶向区域精度高

3. CMA:10~50Kb,全基因组高精度拷贝数

4. WES:单碱基水平,最高分辨率

 

3. 可检测异常类型

 

- 核型

染色体数目异常、易位、倒位、大片段缺失/重复、嵌合体

无法:微小缺失、点突变、微重复

- FISH

特定位点缺失、重复、扩增、染色体数目、已知微缺失综合征

无法:未知变异、全基因组筛查、点突变

- CMA

全基因组拷贝数变异CNV(微缺失/微重复)、数目异常

无法:平衡易位、倒位、单基因点突变、低比例嵌合体

- WES

外显子区点突变、小InDel、单基因遗传病、部分CNV

无法:内含子/非编码区、大片段结构变异、平衡染色体畸变

 

4. 检测覆盖范围

 

- 核型:全染色体宏观结构,无基因水平

- FISH:靶向少数已知位点,定点筛查

- CMA:全基因组无死角拷贝数筛查

- WES:人类全部外显子区域(约1%基因组,覆盖85%致病突变)

 

5. 嵌合体检出能力

 

- 核型:最优,可检出低比例嵌合(5%以上)

- FISH:较好,可检测细胞水平嵌合

- CMA:差,仅高比例嵌合可检出

- WES:最差,几乎难以识别低比例嵌合体

 

6. 平衡结构畸变检出

 

平衡易位、染色体倒位

 

- 核型:唯一可常规检出

- FISH:部分可检出

- CMA:完全不能检出

- WES:完全不能检出

 

7. 检测周期

 

- 核型:7~14天(需细胞培养,耗时最长)

- FISH:1~3天,最快

- CMA:3~7天

- WES:10~20天,流程最复杂

 

8. 适用临床场景

 

1. 核型

孕前产检唐筛高风险、反复流产、不孕