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转录中介体复合物亚基20在肝细胞癌中的高表达、预后价值及免疫调控作用研究
作者: 任超胜
单位: 西安医学院第一附属医院

摘要

采用生物信息学方法系统探究了转录中介体复合物亚基20(Mediator complex subunit 20,MED20)在肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma, HCC)中的表达与功能。HCC作为全球高发且预后较差的恶性肿瘤之一,转录中介体复合物在真核生物基因转录调控中发挥关键作用,其中MED20作为该复合物的核心组分之一,在HCC中的表达特征及生物学功能尚缺乏系统研究

从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载HHC的RNA-seq转录组数据及对应的临床病理信息、从基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expressio)数据库获取110例正常肝组织的RNA-seq数据。首先对MED20在HCC中的表达进行差异分析,并评估其与临床病理特征的相关性。其次利用生存分析(Kaplan-Meier、Cox回归)评估其预后价值,并通过基因集富集分析(GSEA)探索相关信号通路。最后采用免疫细胞反卷积算法(CIBERSORT)及相关性分析,揭示MED20表达与肿瘤免疫微环境特征之间的关联。

MED20在HCC组织中显著高表达,且与晚期T分期、高病理分期、高组织学分级及高AFP水平等不良临床特征显著相关;进一步生存分析提示MED20高表达在患者总生存OS、疾病特异性生存DSS和无进展生存期PFI处于的独立危险因素;接着在基因集富集分析表明,HCC中的MED20主要参与了DNA修复、细胞周期调控、泛素介导的蛋白降解及相关信号通路在KEGG分析中显著富集,并且在自噬调控、核糖体生物合成、染色体结构维持以及泛素连接酶与激酶活性等功能显著激活;同时MED20高表达显著富集于“DNA复制”、“细胞周期”及“Wnt信号通路”等与肿瘤增殖和干细胞特性相关的通路;最后相关性分析显示,MED20表达在HCC中与多个的免疫检查点分子的表达水平呈显著正相关,接着通过Spearman相关散点图进一步揭示了MED20表达量与B细胞、细胞毒性T细胞、树突状细胞、T细胞、Th1细胞和中性粒细胞的浸润程度呈负相关。

MED20是HCC中一个关键的致癌基因,可作为独立的预后生物标志物。其通过驱动细胞周期和激活免疫抑制微环境促进HCC进展,提示MED20可能是HCC免疫治疗的潜在新靶点。

关键词: 肝细胞癌;MED20
来源:第十届中国研究型医院学会肝病专委会学术会议