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崔静静+首都医科大学附属北京朝阳医院
作者: 崔静静
单位: 首都医科大学附属北京朝阳医院

摘要

一、详细多维度深度对比

1)技术原理维度

- 核型分析:G显带染色,显微镜下观察染色体条数、形态、结构重排。

- FISH:荧光探针与目标染色体区域杂交,看信号数目判断非整倍体。

- CMA:全基因组芯片扫描,精准检测拷贝数变异CNV(缺失/重复)。

- WES:高通量测序,捕获全部外显子,检测点突变、小插入缺失、部分CNV。

2)分辨率维度(从低到高)

1. 核型:5–10 Mb(只能看大片段异常)

2. FISH:100 kb~数Mb(只能看探针覆盖区)

3. CMA:10–100 kb(微小缺失/重复全能抓)

4. WES:单碱基级(点突变、极小微缺失)

3)样本与实验维度

- 核型:必须细胞培养,失败率较高,周期长。

- FISH/CMA/WES:不需培养,直接用DNA,成功率高、稳定。

4)可检测疾病类型

- 核型:染色体数目异常、大片段缺失重复、平衡易位/倒位。

- FISH:21/18/13/性染色体非整倍体,特定微缺失综合征。

- CMA:全基因组CNV、微缺失微重复综合征、非整倍体。

- WES:单基因病、孟德尔遗传病、不明原因结构畸形。

5)关键检出能力(临床最关心)

- 平衡易位:只有核型能查,FISH/CMA/WES都不行。

- 非整倍体:全部都能查;CMA最准最全面。

- 微缺失/重复(CNV):CMA最强;WES可辅助但不如CMA。

- 点突变/小Indel:只有WES能查。

6)产前诊断适用场景

- 核型:传统一线,现在多用于CMA互补。

- FISH:快速急诊报告(1–3天),不做最终诊断。

- CMA:产前诊断首选金标准(超声异常、侵入性指征)。

- WES:核型+CMA正常但超声异常,疑难结构畸形。

7)对超声结构异常的诊断率

- 核型:约1–3%

- FISH:几乎不提升

- CMA:额外+6%

- WES:CMA阴性后再+10–12.5%

8)意义未明变异(VOUS)

- 核型/FISH:极少

- CMA:较多(1–3%)

- WES:非常多,解读难度最大

9)时效与周期

- 核型:7–14天

- FISH:1–3天(快)

- CMA:3–7天

- WES:7–14天(最慢)

10)费用维度(由低到高)

核型 < FISH < CMA < WES

11)优势与短板

- 核型

优:看平衡易位、完整染色体全貌。

缺:慢、分辨率低、依赖培养。

- FISH

优:快、便宜、适合急诊快速排除常见三体。

缺:只能看固定位点,不全面。

- CMA

优:产前诊断最优,无培养、全基因组CNV、分辨率高。

缺:看不出平衡易位,有VOUS。

- WES

优:单基因病终极手段,结构畸形疑难必备。

缺:最贵、最慢、解读最难、VOUS多。

12)临床定位(按当前指南)

1. 常规侵入性诊断:CMA为首选,核型可作为补充。

2. 快速报告:FISH/QF-PCR。

3. 怀疑平衡易位:核型。

4. 超声异常+CMA正常:WES。

二、一句话总结(方便记忆)

- 核型看大结构,能查平衡易位

- FISH看快速三体

- CMA看全基因组微缺失重复(产前首选)

- WES看点突变与单基因病(疑难终极)