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杨莉+通州妇幼保健院
作者: 杨莉
单位: 北京市通州区妇幼保健院

摘要


第二次作业:请从尽可能多的维度比较以下技术:染色体核型分析,荧光原位杂交,染色体微阵列分析和全外显子分析

 

染色体核型分析,荧光原位杂交(FISH),染色体微阵列分析(CMA)和全外显子分析(WES)多维度比较

 

 1. 技术层级与临床定位

染色体核型是产前诊断基础金标准,主打染色体大结构、数目异常和平衡携带筛查;

FISH是快速靶向急诊工具,只做已知常见染色体病和定点微缺失排查;

CMA是分子核型,用来弥补传统核型分辨率不足,做全基因组微小拷贝数异常普查;

WES是单基因罕见病终极排查,在前两项均无结果时,找单点基因突变病因。

2. 分辨率与漏诊特点

核型分析只能看大块染色体,临床很多微缺失微重复综合征直接漏过;

FISH 只能看指定几个点位,不在探针范围内的致病变异完全发现不了;

CMA 能看全基因组细小片段增减,是目前胎儿超声异常首选二线检测;

WES 能看到单个碱基变化,专门解决前面三项都查不出的罕见单基因病。

3. 特殊遗传变异实际检出差异

只有核型能临床确诊平衡易位、倒位,其余三项都做不到;

FISH最适合查低比例嵌合,临床羊穿快速排畸首选;

CMA独有能力检出LOH、UPD 单亲二体,这是核型和 FISH 常规做不到的;

WES唯一能确诊各类单基因点突变、小片段插入缺失遗传病。

4. 标本条件与出报告时效

核型依赖细胞培养,标本不合格、细胞不长就无法出结果,等待时间最长

FISH、CMA、WES 都不用养细胞,只要DNA合格就能检测;

临床加急、胎儿预后决策紧急时,首选 FISH;常规结构异常选CMA;疑难罕见病再上WES。

5. 临床选用逻辑

只要涉及备孕建档、高龄羊穿、夫妇染色体排查、平衡易位,必做核型;

想要快速出结果、加急排 211813 三体、已知微缺失家系验证,选 FISH

胎儿超声结构异常、NT增厚、核型正常仍找不到病因,直接加做CMA

胎儿多发畸形、核型+CMA 都阴性,或有家族遗传病史反复不明原因流产,再行WES测序

6. 解读与临床风险

核型、FISH 结果清晰,临床咨询简单、家属易理解;

CMA 最大问题是检出大量VUS,既不能确诊也不能完全排除,容易引发医患沟通压力;

WES变异海量,良性变异、可疑变异、致病变异混杂,必须专业遗传咨询,不能随意临床下结论。