通过对Sjogren's syndrome患者（pSS)外周血单个核细胞（PBMC）的转录组分析，系统描绘以干扰素刺激基因（ISGs）为核心的转录特征，量化该特征并评估其临床相关性，同时明确其在T细胞亚群中的来源。

总纳入28例样本，其中12例pSS患者与10例健康对照（HC）进行PBMC转录组测序，另纳入3例pSS患者与3例健康对照进行单细胞转录组测序。通过差异表达分析鉴定关键基因，利用GO和KEGG数据库进行功能富集分析。基于核心ISGs（包括 IFI27、IFI44、ISG15、IFIT2、IFIT3、MX1、MX2、OAS1、OAS3、LY6E、STAT1、IRF7）计算每个样本的平均表达量作为IFN特征评分。采用Wilcoxon秩和检验比较组间差异，Spearman相关分析评估评分与临床指标的相关性，ROC曲线评估评分的诊断效能。通过单细胞数据分析T细胞亚群分布及IFN特征的细胞来源。

12例pSS患者与10例健康对照（HC）转录组分析共检测到16,140-16,889个基因，与健康对照组相比，治疗前pSS患者共鉴定出236个上调基因和188个下调基因（|log2FC|≥1，p<0.05）。上调基因显著富集于I型干扰素信号通路、JAK-STAT信号通路及抗原加工与呈递。基于12个核心ISGs构建的IFN特征评分显示，治疗前患者评分（中位数75.25）显著高于健康对照（中位数21.58，P<0.001），治疗后患者评分（中位数60.46）显著低于治疗前（P<0.01），但仍高于健康对照（P<0.05）。ROC曲线分析显示，该评分区分治疗前患者与健康对照的曲线下面积（AUC）为0.97。单细胞数据分析显示，IFN特征主要富集于T细胞，特别是CD8+效应记忆T细胞（CD8+ Tem）和GDT细胞。与健康对照相比，pSS患者初始T细胞比例呈下降趋势，而CD8+ Tem和GDT细胞比例呈上升趋势。蛋白互作网络分析识别出STAT1、IRF7、STAT4为hub基因，KEGG富集分析显示这些基因高度富集于JAK-STAT信号通路。

pSS患者外周血中存在以干扰素刺激基因为核心的强转录特征，该特征可量化为综合评分，能有效区分患者与健康对照，且与疾病活动度相关。