摘要
在日常产前诊断工作里,我们经常要在这四种技术里做选择,它们各有分工、不能互相完全替代。
一、检测原理与看什么
染色体核型分析:把细胞养到中期,染色后在显微镜下看整条染色体的数量和形态。相当于给染色体拍一张“全身照”,看数目对不对、有没有大的结构问题。 FISH(荧光原位杂交):用荧光探针去“标记”特定染色体或片段,看信号有几个。属于定点检查,只看我们关心的那几条或那一段。
CMA(染色体微阵列):用芯片全基因组扫描,比对DNA拷贝数。相当于给染色体做“高精度扫描”,能发现很小的缺失或重复。
全外显子测序(WES):把所有编码蛋白的基因区域测序。是在基因级别找突变,看点突变、小缺失插入这些核型和CMA看不到的问题。
二、分辨率
核型:只能看到5Mb以上的大改变,太小的看不出来。
FISH:看探针设计,一般100kb到几Mb,只查目标区域。
CMA:精度很高,50kb左右的微缺失微重复都能检出。
WES:精度最高,单个碱基的突变都能识别。
三、能查什么、不能查什么
核型 能:染色体数目异常、大片段缺失重复、平衡易位、倒位、罗伯逊易位。 不能:微缺失微重复、点突变。
FISH 能:21/18/13/X/Y快速计数、已知特定区域异常。 不能:全基因组筛查、平衡易位、点突变。
CMA 能:全基因组微缺失/微重复、嵌合、UPD、三倍体(SNP芯片)。 不能:平衡易位、倒位、点突变。
WES 能:单基因病、点突变、小片段插入缺失。 不能:染色体数目、平衡易位、大部分CNV。
四、要不要细胞培养
核型:必须培养,培养失败就做不了。
FISH:不用培养,间期细胞就可以做。
CMA:不用培养,提DNA就行。
WES:不用培养,提DNA就行。
五、出结果时间
核型:7–14天,比较慢。
FISH:1–3天,最快,适合紧急情况。
CMA:3–7天,速度中等。
WES:最慢,一般2–4周。
六、临床最适合什么时候用
核型分析 怀疑染色体数目异常;夫妻有反复流产;需要查平衡易位、罗伯逊易位;传统确诊金标准。
FISH 急诊快速判断21/18/13/X/Y数目,不适合当全面筛查。
CMA 胎儿结构畸形首选;超声异常但核型正常;死胎标本;找微缺失微重复。 WES 胎儿多发结构异常、严重发育异常,但核型和CMA都正常;高度怀疑单基因病时才用。
七、优势和短板
核型:唯一能稳定查平衡易位,但分辨率低、依赖培养。
FISH:快、便宜、不用培养,但只能查固定位点。
CMA:分辨率高、全基因组、不挑样本,但看不出平衡易位。
WES:能找单基因病因,但最贵、周期最长、解读最难,还容易出意义不明的变异。
八、临床中的选择思路
普通高龄、唐筛高风险:优先核型。
胎儿结构异常:直接上CMA。
紧急要结果:先做FISH快速参考,再补核型或CMA。
前面都正常但胎儿问题很重:再考虑WES。
